Hidroviário
O primeiro porto da cidade funcionou na foz do Rio Ceará que ainda abriga embarcações pesquiras. Com a construção do Forte Schoonenborch em 1649 nas proximidades do riacho Pajeú pelos holandeses, uma estrutura de atracação foi pretendida como porto por 300 anos com a elaboração de projetos e construção da Ponte Metálica e da Ponte dos Ingleses. Finalmente foi construído na década de 1950 o Porto do Mucuripe que veio a transformar a estrutura da cidade. O cais tem 1.054 metros de extensão. Tem uma plataforma de atracação exclusiva para petrolíferos. Sua área de armazéns tem seis mil metros quadrados e mais de 100 mil metros quadrados de pátio para contêineres. Possui ainda três moinhos de trigo e está interligado ao sistema ferroviário por um extenso pátio de manobras.